بر اساس ماده ۱۱۹ قانون امور گمرکی ، معافیت گمرکی بر اساس یکی از موارد زیر اعطا می شوند: ۱.موارد ذکر شده در جدول تعرفه گمرکی ضمیمه آیین نامه اجرایی قانون مقررات صادرات و واردات ، ۲.معافیت هایی که به موجب قوانین برقرار شده است، ۳. معافیت هایی که به موجب تصویب نامه ها ،…

از مهم ترین اختلافاتی که بین صاحب کالا و گمرک رخ می دهد , اختلافات گمرکی ناشی از ارزش کالا می باشد .

اختلافات گمرکی پس از ترخیص کالا ممکن است راجع به ارزش کالا یا تعرفه کالا (غیر از قاچاق گمرکی) و سایر موارد در اجرای مقررات گمرکی قبل ....

اعتراض به ضبط ضمانت نامه یا وثیقه گمرکی در صورتی می تواند قابل پذیرش باشد که گمرک میزان قانونی تضمین را رعایت نکرده و ضرری به صاحب کالا وارد شود در این صورت گمرک در قبال صاحب کالا مسئولیت دارد.

اختلاف صاحب کالا و گمرک در ارزش کالا بنا به ماده و 146 144 قانون امور گمرکی، درکمیسیون رسیدگی به اختلافات گمرکی مورد بررسی  و رسیدگی قرار می گیرد.

بنا به ماده 219 آیین نامه اجرایی قانون امور گمرکی ایران، چنانچه معلوم شود تمام يا مبلغي از وجه سپرده اضافه دريافت شده است می توان با اعلام اعتراض به مبالغ اضافه دریافتی و بهره آن و الزام به استرداد توسط گمرک، با رعايت مقررات مربوط به اضافه دريافتي اقدام نماید.